Después de descubrir una espada misteriosa en el almacén de su casa, la estudiante de tercer año de secundaria Yui Kusanagi se encuentra repentinamente transportada a un mundo diferente. Mientras explora su nuevo entorno, conoce a cinco hombres extraños pero apuestos antes de encontrarse cara a cara con Zeus: el rey de los dioses.
Para restaurar la deteriorada relación entre los dioses y los humanos, Zeus ha creado la Academia de los dioses y ha elegido a Yui para que sea su única instructora. Tiene un año para educar a las deidades jóvenes y reacias, incluidos los cinco extraños que conoció antes, sobre lo que significa ser humano mientras aprende sobre los dioses; de lo contrario, todos quedarán atrapados en el reino de Zeus para siempre.
