Cuando una extraña chica llamada Guri llama a la puerta de Seiji Aino, rápidamente se ve envuelto en un mundo de problemas románticos. Afirmando que ella morirá si él no besa a alguien dentro de las 24 horas, las súplicas de desesperación de Guri se malinterpretan como súplicas de amor, lo que lleva a Seiji a besar al lindo extraño que irrumpió en su casa. En realidad, resulta que este Cupido disfrazado es el portador de una Nota de beso, en la que cualquier combinación de nombres que ella escriba se besará y se convertirá en pareja. Guri explica que escribió mal y accidentalmente escribió el nombre de Seiji mientras se entregaba a sus fantasías yaoi, pero como aún no lo había emparejado con nadie, su beso no tenía sentido. Peor aún, Guri revela que si Seiji no se empareja con nadie pronto, no solo ella morirá, ¡sino que Seiji permanecerá virgen por la eternidad!
Ansioso por escapar de su destino, Seiji fija su mirada en la hermosa y popular Akane Hiyama. Pero después de que Akane se entera de que besó a Guri, revela los sentimientos obsesivos y psicópatas que tiene por el desafortunado chico y procede a atacarlos brutalmente. En la confusión que siguió, Guri puede emparejar a Seiji con Akane en Kiss Note, salvando temporalmente a Seiji de cualquier daño corporal adicional. Pero para complicar las cosas, los nuevos sentimientos de Guri la llevan a emparejarlos a ellos dos consigo misma. Justo cuando la situación no podía volverse más complicada, esta nueva pareja con Guri ha convertido a Seiji y Akane en ángeles temporales, obligándolos a ayudar a Cupido con su trabajo de emparejar humanos, para que no sean arrojados al infierno. Con toda apariencia de normalidad arrebatada de su vida, Seiji se pone a trabajar en el emparejamiento con estas chicas excéntricas a su lado.
